En las ocasiones en que se utiliza PROTEUS para diseñar un esquema electrónico con destino a la construcción de una placa de circuito impreso, puede resultar incómodo experimentar el comportamiento del esquema completo ejecutando su simulación. Por ejemplo, no es habitual simular el comportamiento de un cristal como si se tratara de un circuito analógico cuando se está utilizando para generar los pulsos de relój de un microprocesador, cuyo comportamiento es lo que realmente queremos simular.
 
Generador de ondas virtual en proteus
 
Proteus facilita esta tarea y evita tener que dividir e ir probando el esquema por partes, al permitir la simulación parcial de un diseño. La topología del circuito es analizada automáticamente y, sólo aquellos componentes que se encuentran entre el generador de señal y la sonda de medida son incluídos en la simulación.